导致少精症的原因很多，如隐睾、精索静脉曲张、内分泌失调、维生素及微量元素缺乏、病原微生物感染、药物影响等各种因素。大多数少精症只要仔细询问病史，进行详细的体格检查，再配合实验室检查是可以找到病因的。常见的导致少精症的原因有以下七种：
少精症的原因1.精索静脉曲张 精索静脉曲张时，使睾丸的局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响睾丸生精功能。但精索静脉曲张程度与精子质量不成比例。
少精症的原因2.隐睾 隐睾是影响精液质量的重要原因之一。单侧隐睾约60%病人不育，因此若精子密度低，又有隐睾存在，必须及早治疗。
少精症的原因3.生殖道感染 附属生殖腺的慢性感染，可以影响精液中的各种化验指标。
少精症的原因4.自身免疫 生殖免疫学研究发现，男性自身免疫可影响生育能力，抗精子抗体可影响精子的产生和运送。
少精症的原因5.内分泌异常 男性正常生精功能依靠于下丘脑—垂体—性腺轴功能的正常，其中任何一环节障碍，都会影响生精功能，其它如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
少精症的原因6.染色体异常 染色体畸变对精子密度、活动率及形态均有严重影响。
少精症的原因7.其它 阴囊温度过高，放射损伤，化学毒品及药物影响均可造成少精症。
