卵巢囊肿是指卵巢内有囊性的肿物形成，可分为肿瘤性和非肿瘤性两类，肿瘤性囊肿即为卵巢肿瘤，非肿瘤性囊肿包括卵巢的功能性囊肿以及子宫内膜异位囊肿。
生育年龄的妇女较容易发生的卵巢囊肿是卵巢的功能性囊肿，它是由于卵巢本身或药物刺激造成的过度生理性反应所致，患者一般没有任何感觉或不适，少数人可能症状会有月经失调，多因其它原因就医检查时意外发现卵巢功能性囊肿，直径大多小于5厘米，能够自然消失，一般不需要治疗。
卵巢囊肿的另一常见原因是卵巢肿瘤，可发生于任何年龄，但多见于育龄妇女，是妇科常见肿瘤，约占女性生殖系统肿瘤的三分之一。一般如果囊肿怀疑是肿瘤性质的，在超声上表现为实性或者囊实性的包块，伴有Ca125的升高，如果怀疑是卵巢肿瘤性质的，应该尽早进行手术治疗。卵巢的囊性肿瘤多为良性，但偶也会有恶性的可能。因此一旦确诊为卵巢肿瘤应当尽早手术治疗。
对于在查体时候发现的无回声的囊肿是临床中比较常见的，未必就是一种病理性的状态。在育龄期每个月卵巢均会有滤泡、黄体的形成，此时的囊肿一般伴随着生理周期会消失。发现无回声的囊肿，可以进行系列的随诊，如果3个月后囊肿消失就无需进行特殊处理。
巧克力囊肿：卵巢子宫内膜异位囊肿又名卵巢巧克力囊肿，也是较为常见的卵巢囊肿。是由于子宫内膜异位症波及卵巢，在卵巢内形成含有巧克力样黏稠液体的囊肿。肿块的大小不一，大的直径可在10厘米以上。患者常有进行性加重的痛经、性交痛、不孕以及月经失调。妇科检查时盆腔有触痛性结节。卵巢巧克力囊肿的治疗，要根据患者的年龄、囊肿大小、痛经程度、有无生育要求等综合考虑，分别采取药物、保守性手术直至根治性手术治疗。
可见卵巢囊肿是卵巢囊性肿块的统称，它对于身体的危害以及对它的治疗，取决于它的性质。对30岁以上妇女来说，即使无任何不适，每年都应体格仔细检查一次，包括进行妇科检查。如果发现卵巢囊肿，应进一步检查，明确是功能性、肿瘤性还是子宫内膜异位囊肿，以采取不同的治疗。
